MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 plasmid 1

Total Repeats: 373

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007615	T	7	7	90	96	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007615	A	6	6	97	102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007615	A	6	6	280	285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007615	AAT	2	6	302	307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007615	TTCTT	2	10	338	347	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007615	AT	3	6	363	368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007615	AAC	2	6	426	431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007615	AAGA	2	8	443	450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007615	CT	3	6	472	477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007615	AAG	2	6	512	517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007615	A	6	6	547	552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007615	ATC	2	6	630	635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007615	CA	3	6	638	643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007615	GTCA	2	8	656	663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007615	ACTA	2	8	668	675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007615	AGA	2	6	710	715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007615	A	6	6	741	746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007615	TGC	2	6	785	790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007615	A	6	6	862	867	100 %	0 %	0 %	0 %	82703894
20	NC_007615	AGCA	2	8	869	876	50 %	0 %	25 %	25 %	82703894
21	NC_007615	GAT	2	6	913	918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703894
22	NC_007615	CAGG	2	8	949	956	25 %	0 %	50 %	25 %	82703894
23	NC_007615	CCA	2	6	962	967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703894
24	NC_007615	GCA	2	6	985	990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703894
25	NC_007615	CAG	2	6	1012	1017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703894
26	NC_007615	TGG	2	6	1101	1106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703894
27	NC_007615	GTG	2	6	1153	1158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703894
28	NC_007615	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703894
29	NC_007615	CCG	2	6	1189	1194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703895
30	NC_007615	AGT	2	6	1213	1218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703895
31	NC_007615	CTTAT	2	10	1221	1230	20 %	60 %	0 %	20 %	82703895
32	NC_007615	CTA	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703895
33	NC_007615	GTG	2	6	1267	1272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703895
34	NC_007615	TACT	2	8	1287	1294	25 %	50 %	0 %	25 %	82703895
35	NC_007615	ATT	2	6	1413	1418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703895
36	NC_007615	AGC	2	6	1455	1460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703895
37	NC_007615	AAGCAA	2	12	1470	1481	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	82703895
38	NC_007615	AT	3	6	1664	1669	50 %	50 %	0 %	0 %	82703895
39	NC_007615	CCA	2	6	1716	1721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703895
40	NC_007615	GCAG	2	8	1774	1781	25 %	0 %	50 %	25 %	82703895
41	NC_007615	GCA	2	6	1799	1804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703895
42	NC_007615	GGC	2	6	1847	1852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703895
43	NC_007615	TTG	2	6	1860	1865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703895
44	NC_007615	GC	3	6	1931	1936	0 %	0 %	50 %	50 %	82703895
45	NC_007615	A	6	6	1984	1989	100 %	0 %	0 %	0 %	82703895
46	NC_007615	AAC	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703895
47	NC_007615	CCTG	2	8	2005	2012	0 %	25 %	25 %	50 %	82703895
48	NC_007615	CAGC	2	8	2063	2070	25 %	0 %	25 %	50 %	82703895
49	NC_007615	CAA	3	9	2104	2112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703895
50	NC_007615	TCC	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703895
51	NC_007615	TGAA	2	8	2130	2137	50 %	25 %	25 %	0 %	82703895
52	NC_007615	TCA	2	6	2141	2146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703895
53	NC_007615	AAT	2	6	2171	2176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703895
54	NC_007615	ATGA	2	8	2189	2196	50 %	25 %	25 %	0 %	82703895
55	NC_007615	TGG	2	6	2207	2212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703895
56	NC_007615	AGTC	2	8	2224	2231	25 %	25 %	25 %	25 %	82703895
57	NC_007615	GAAAGG	2	12	2354	2365	50 %	0 %	50 %	0 %	82703895
58	NC_007615	TGAT	2	8	2372	2379	25 %	50 %	25 %	0 %	82703896
59	NC_007615	AGC	2	6	2430	2435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703896
60	NC_007615	TTA	2	6	2447	2452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703896
61	NC_007615	TGC	2	6	2501	2506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703896
62	NC_007615	CAG	2	6	2526	2531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703896
63	NC_007615	TGT	2	6	2658	2663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703896
64	NC_007615	CAG	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703896
65	NC_007615	A	7	7	2814	2820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007615	A	6	6	2824	2829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007615	TTG	2	6	2849	2854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007615	GTT	2	6	2893	2898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007615	GGT	2	6	2906	2911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007615	AAC	2	6	2925	2930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007615	TCA	2	6	2932	2937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007615	GCAAT	2	10	2954	2963	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_007615	GCA	2	6	2985	2990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007615	AGA	2	6	3018	3023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007615	AGC	2	6	3078	3083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703897
76	NC_007615	ACT	2	6	3095	3100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703897
77	NC_007615	TC	3	6	3104	3109	0 %	50 %	0 %	50 %	82703897
78	NC_007615	GGA	2	6	3162	3167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703897
79	NC_007615	G	6	6	3233	3238	0 %	0 %	100 %	0 %	82703897
80	NC_007615	TTG	2	6	3408	3413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703897
81	NC_007615	GCC	2	6	3426	3431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703897
82	NC_007615	GGCA	2	8	3444	3451	25 %	0 %	50 %	25 %	82703897
83	NC_007615	GGA	2	6	3453	3458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703897
84	NC_007615	CAGT	2	8	3544	3551	25 %	25 %	25 %	25 %	82703897
85	NC_007615	CAT	2	6	3554	3559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703897
86	NC_007615	TGA	2	6	3602	3607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703897
87	NC_007615	ACT	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703897
88	NC_007615	A	6	6	3739	3744	100 %	0 %	0 %	0 %	82703897
89	NC_007615	ATC	3	9	3864	3872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703897
90	NC_007615	CAG	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703897
91	NC_007615	GCGG	2	8	3944	3951	0 %	0 %	75 %	25 %	82703897
92	NC_007615	GAC	2	6	4041	4046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703897
93	NC_007615	TAC	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703897
94	NC_007615	AACC	2	8	4208	4215	50 %	0 %	0 %	50 %	82703897
95	NC_007615	GAT	2	6	4229	4234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703897
96	NC_007615	GC	4	8	4238	4245	0 %	0 %	50 %	50 %	82703897
97	NC_007615	CCAG	2	8	4282	4289	25 %	0 %	25 %	50 %	82703897
98	NC_007615	CG	3	6	4333	4338	0 %	0 %	50 %	50 %	82703897
99	NC_007615	GAA	2	6	4402	4407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703897
100	NC_007615	T	6	6	4464	4469	0 %	100 %	0 %	0 %	82703897
101	NC_007615	AGG	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703897
102	NC_007615	A	6	6	4494	4499	100 %	0 %	0 %	0 %	82703897
103	NC_007615	G	6	6	4535	4540	0 %	0 %	100 %	0 %	82703897
104	NC_007615	GGC	2	6	4569	4574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703897
105	NC_007615	CTG	3	9	4652	4660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703898
106	NC_007615	TATT	2	8	4744	4751	25 %	75 %	0 %	0 %	82703898
107	NC_007615	TTC	2	6	4890	4895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703898
108	NC_007615	CTT	2	6	4922	4927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703898
109	NC_007615	T	6	6	4949	4954	0 %	100 %	0 %	0 %	82703898
110	NC_007615	CGT	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703898
111	NC_007615	CAGT	2	8	5078	5085	25 %	25 %	25 %	25 %	82703898
112	NC_007615	AGC	2	6	5104	5109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703898
113	NC_007615	CCAG	2	8	5168	5175	25 %	0 %	25 %	50 %	82703898
114	NC_007615	ATAA	2	8	5181	5188	75 %	25 %	0 %	0 %	82703898
115	NC_007615	CGC	2	6	5207	5212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_007615	TA	3	6	5225	5230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007615	CCA	2	6	5304	5309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703899
118	NC_007615	AAT	2	6	5384	5389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703899
119	NC_007615	CCTT	2	8	5433	5440	0 %	50 %	0 %	50 %	82703899
120	NC_007615	CCTT	2	8	5454	5461	0 %	50 %	0 %	50 %	82703899
121	NC_007615	GCCA	2	8	5499	5506	25 %	0 %	25 %	50 %	82703899
122	NC_007615	CGGC	2	8	5605	5612	0 %	0 %	50 %	50 %	82703899
123	NC_007615	C	6	6	5679	5684	0 %	0 %	0 %	100 %	82703900
124	NC_007615	ATT	2	6	5839	5844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703900
125	NC_007615	T	6	6	5843	5848	0 %	100 %	0 %	0 %	82703900
126	NC_007615	GCA	2	6	5858	5863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703900
127	NC_007615	ATA	2	6	5904	5909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007615	TAT	2	6	5912	5917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007615	GCAA	2	8	5928	5935	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007615	A	6	6	5934	5939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007615	GGA	2	6	5944	5949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007615	CGA	2	6	5959	5964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007615	GCTGGA	2	12	5965	5976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_007615	ATC	2	6	6057	6062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007615	CG	3	6	6234	6239	0 %	0 %	50 %	50 %	82703901
136	NC_007615	TGC	2	6	6424	6429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703901
137	NC_007615	CTG	2	6	6469	6474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703901
138	NC_007615	AGC	2	6	6506	6511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703901
139	NC_007615	A	6	6	6687	6692	100 %	0 %	0 %	0 %	82703902
140	NC_007615	AT	3	6	6771	6776	50 %	50 %	0 %	0 %	82703902
141	NC_007615	A	7	7	6848	6854	100 %	0 %	0 %	0 %	82703902
142	NC_007615	CCG	2	6	6859	6864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703902
143	NC_007615	CCAT	2	8	6870	6877	25 %	25 %	0 %	50 %	82703902
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.